，诏封他为岐王。李茂贞无功加封，益令他飞扬跋扈。改元天复，大賚功臣子孙。昭宗又要进位崔胤为司徒，崔胤坚辞不就，以示谦虚。但他还是辅领朝政，兼领三司诸使，执掌大权。昭宗对他更为信任，召见之时竟然不喊他的名，而以字称呼，一时宠爱万千，无与伦比。
崔胤和陆扆，联名上疏，说道：“国家祸乱，都是由中官典兵，乞令臣崔胤主持左军，臣陆扆主持右军，如此宦官无从专擅职权，各地诸侯也不敢侵陵，王室自然渐尊了。”李茂贞闻了此言，认为崔胤等人想翦灭诸侯，大加反对。昭宗召李继昭、李继诲、李彦弼三人入商，三人同声说道：“臣等累世在军中，没有听说过书生可为军帅。而且且禁军若属南司，必多所变更，不若仍归北司为便。”
于是昭宗又命枢密使韩全诲，凤翔监军张彦弘为左右军尉，另用袁易简、周敬容为枢密使。李茂贞辞行还镇，崔胤与李茂贞商议，令留兵三千人，充作宿卫，监督宦官。李茂贞允诺，令养子李继筠为将，率三千人留在京城。谏议大夫韩偓道：“留此兵必为国患。”崔胤不肯听从。
崔胤日日想着裁抑宦官，削除内柄。杨复恭为中尉时，曾向度支使借拨卖曲榷赋，赡养两军，此后也没有归偿。崔胤不想让宦官专利，特令酤酒家自己造曲，月输榷钱至度支，并附近各镇也照例办理。李茂贞因此失利，上表乞入朝论奏。韩全诲更是代为申请，乃许李茂贞入朝。李茂贞至京，韩全诲送厚礼和他结交，约为党援。
崔胤开始戒惧，益加和朱温交好，以抵制李茂贞。昭宗倚崔胤为重，事无大小，先咨后行，每日召崔胤坐论，至晚方休。崔胤以除绝宦官为志，奏对时辄加怂恿，宦官越发对他侧目。中书舍人令狐涣，以及谏议大夫韩偓，已擢为翰林学士，听说崔胤想尽诛宦官，便从旁屡谏，说道如果相持过急，恐防他变，崔胤却始终没有省悟。
蹉跎蹉跎，过了半年，昭宗召韩偓入问道：“敕使中多半为恶，如何处置？”韩偓答道：“前时东宫发难，敕使都是同恶，欲加处置，应在那个时候，今已错过了时机。”
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